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アイテム
転写配列クラスタリングによる新規SNPsの同定
https://repo.qst.go.jp/records/67371
https://repo.qst.go.jp/records/67371c73eb1a8-4934-4cfd-b9bf-df06880457c1
| Item type | 会議発表用資料 / Presentation(1) | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2003-04-30 | |||||
| タイトル | ||||||
| タイトル | 転写配列クラスタリングによる新規SNPsの同定 | |||||
| 言語 | ||||||
| 言語 | jpn | |||||
| 資源タイプ | ||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_c94f | |||||
| 資源タイプ | conference object | |||||
| アクセス権 | ||||||
| アクセス権 | metadata only access | |||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_14cb | |||||
| 著者 |
斎藤, 俊行
× 斎藤, 俊行× 林, 昭子× 齋藤 俊行× 林 昭子 |
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| 抄録 | ||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||
| 内容記述 | 【目的】DNA多型は個体識別に利用されるが，特にゲノム中に数百万ヵ所存在すると推定されるSNPs（1塩基多型）は有力な情報である．本研究では，大量に蓄積された公共遺伝子データベース中の転写配列情報を元に，新たなSNPs候補の推定と検出をおこなう支援ツールの開発を目指した．【方法】多数の独立個体材料から取得されたmRNA配列約10万および部分的mRNA配列約470万件を，塩基配列相同性によりグループ化し複数配列どうしの共通領域における矛盾塩基をSNP候補としてリスト化した．ここから他の多型データベースで指摘されていない候補について，日本人24人（48アレル）のゲノムDNAを鋳型に当該領域の塩基配列をPCR増幅し塩基配列を決定した．【成績】期待値が10-30％の候補は約1割，期待値30-40％の候補は約3割が確認された．【結論】従来指摘のないエクソン領域SNP候補が10万件以上見つかり，これらの一定数が日本人集団においても検出可能である． | |||||
| 会議概要（会議名, 開催地, 会期, 主催者等） | ||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||
| 内容記述 | 第87次日本法医学会総会 | |||||
| 発表年月日 | ||||||
| 日付 | 2003-04-25 | |||||
| 日付タイプ | Issued | |||||
