WEKO3
アイテム
Activation mapping in multi-center retrospective rat sensory-evoked functional MRI datasets using a unified pipeline
https://repo.qst.go.jp/records/2002953
https://repo.qst.go.jp/records/20029532bfaec51-ceb8-4d34-95c2-528c5330568f
| アイテムタイプ | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2026-03-07 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Activation mapping in multi-center retrospective rat sensory-evoked functional MRI datasets using a unified pipeline | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
Marie E Galteau
× Marie E Galteau
× Margaret Broadwater
× Yi Chen
× Gabriel Desrosiers-Gregoire
× Rita Gil
× Johannes Kaesser
× Eugene Kim
× Pervin Kıryağdı
× Henriette Lambers
× Yanyan Y Liu
× Xavier López-Gil
× Eilidh MacNicol
× Parastoo Mohebkhodaei
× Ricardo X N De Oliveira
× Carolina A Pereira
× Henning M Reimann
× Alejandro Rivera-Olvera
× Erwan Selingue
× Nikoloz Sirmpilatze
× Sandra Strobelt
× Akira Sumiyoshi
× Channelle Tham
× Raul Tudela
× Roël M Vrooman
× Isabel Wank
× Yongzhi Zhang
× Wessel A van Engelenburg
× Jürgen Baudewig
× Susann Boretius
× Diana Cash
× M Mallar Chakravarty
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) in rodents is pivotal for understanding the mechanisms underlying Blood Oxygen Level-Dependent (BOLD) signals and phenotyping animal models of disorders, among other applications. Despite its growing use, comparing rodent fMRI results across different research sites remains challenging due to variations in experimental protocols. Here, we aggregated and analyzed 22 sensory-evoked rat fMRI datasets from 12 imaging centers, totaling scans from 220 rats, to get a snapshot of the current acquisitions in the field. This retrospective analysis highlights common practices and parameters to inform future cross-laboratory standardization efforts. We applied a standardized preprocessing pipeline and evaluated the impact of different hemodynamic response function models on group- and individual-level activity patterns. Our analysis revealed inter-dataset variability attributed to differences in experimental design, anesthesia protocols, and imaging parameters. We identified robust activation clusters in all (22/22) datasets. The comparison between stock human models implemented in software and rat-specific models showed significant variations in the resulting statistical maps. Our findings emphasize the necessity for standardized protocols and collaborative efforts to improve the reproducibility and reliability of rodent fMRI studies. We provide open access to all datasets and analysis code to foster transparency and further research in the field. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
Imaging Neurosci (Camb) 巻 3, p. IMAG.a.157, 発行日 2025-09 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 2837-6056 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubMed番号 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 40995458 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 10.1162/IMAG.a.157 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
