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アイテム
ヒストンH2A-H2B二量体のヌクレオソームからの脱離メカニズム解析
https://repo.qst.go.jp/records/2000357
https://repo.qst.go.jp/records/20003575da5269e-21c7-4dda-aa0d-ee1197de0084
| アイテムタイプ | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||
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| 公開日 | 2024-08-08 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | ヒストンH2A-H2B二量体のヌクレオソームからの脱離メカニズム解析 | |||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||
| 著者 |
石田 恒
× 石田 恒
× 河野 秀俊
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| 抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||
| 内容記述 | 大規模なシミュレーションを実施することにより、ヌクレオソームからH2A-H2B二量体が脱離するときの自由エネルギー地形をABMD自由エネルギー計算法とアンブレラサンプリング法を用いて調べた。どちらの方法でも、H2A-H2B二量体脱離の自由エネルギーは約30 kcal/molと見積もられた。H2A-H2B二量体離脱は、２つのステップでおきることがわかった。１．H2A-H2B二量体とH2A´-H2B´二量体の相互作用の喪失。２．H2A-H2B二量体とH3´-H4´二量体の相互作用、およびH2A-H2B二量体とH3-H4二量体の相互作用の喪失。これらの相互作用喪失のうち、自由エネルギーに特に大きく寄与するのは、H2AドッキングドメインとH4´ C末テールの相互作用であることが示唆された。一方、ヌクレオソーム構造崩壊を引き起こすヒストンシャペロンFACTは、H2AドッキングドメインをH3-H4相互作用接触面から引き離すことが知られている。これらを合わせて考えると、H2Aドッキングドメインの相互作用の喪失がヌクレオソーム構造崩壊の引き金になっていると推察される。 | |||||||||
| 書誌情報 |
HPCI利用研究成果集 巻 8, 号 2, p. 49-58, 発行日 2023-10 |
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| 出版者 | ||||||||||
| 出版者 | 一般財団法人 高度情報科学技術研究機構 | |||||||||
| ISSN | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
| 収録物識別子 | 2189-2644 | |||||||||
